O conhecimento sobre as relações filogenéticas entre os Siluriformes tem progredido continuamente ao longo dos últimos 100 anos. Apesar de controvérsias persistentes, há agora muito mais informações corroboradas por análises independentes e diferentes fontes de dados. Os bagres possuem a distribuição geográfica mais ampla de qualquer Ostariophysi, com presença em todos os continentes e os únicos na Austrália, Nova Guiné, Madagascar e Antártica. Sua história biogeográfica foi ocasionalmente considerada intratável devido à falta de componentes transcontinentais claros. Apresentamos aqui um cenário que tenta reconciliar as noções atuais da filogenia dos bagres com sua geografia, em particular com a história de fragmentação de Gondwana. A hipótese filogenética é baseada em uma análise de supermatriz com 2000+ terminais, modulada por dados morfológicos. Resultados corroboram a posição de Diplomystidae como grupo-irmão dos restantes Siluriformes, com Loricarioidea, Cetopsidae, Doradoidea neotropicais e o clado Clariidae + Plotosidae + Chacidae + Siluridae como grupos-irmãos sucessivos do restante da ordem. Outros clados relevantes incluem (Austroglanididae (Ariidae, Anchariidae)) e (Pangasiidae (Cranoglanididae, Ictaluridae)) e clados amplamente coincidentes com os anteriormente propostos "Grande África" e "Grande Ásia", assim como Lacantuniidae (Am. do Norte) dentro do primeiro clado, como grupo-irmão de Claroteidae. Embora gondwânicos, os Siluriformes não seguem os padrões habituais de divisão dos peixes de água doce relacionados a Gondwana. Sua vasta distribuição hoje é explicada por expansões distribucionais associadas aos estágios iniciais da fragmentação continental e à abertura de vias transitáveis intercontinentais, coincidindo com a invasão de habitats de planícies e estuários por linhagens específicas. A separação dos blocos continentais foi, assim, um fator de “dispersion” (em oposição à “dispersal”) em seus estágios iniciais, proporcionando extensos corredores costeiros pericontinentais. A vicariância intercontinental se efetiva com a abertura das bacias oceânicas. Fósseis de Siluriformes são uma importante fonte de dados, especialmente ao demonstrar ocorrências e distribuições marinhas passadas.
