O gênero Hypostomus é amplamente distribuído desde a América Central à América do Sul, sendo várias espécies com sua ocorrência registrada nos tributários das bacias do Paraná, Paraguai, Uruguai e Amazonas, representando, portanto, um componente significativo da ictiofauna de água doce Neotropical. Sua fauna parasitária inclui monogenéticos, digenéticos, nematoides e hirudíneos, que são comumente encontrados em peixes de água doce. Assim, o objetivo do trabalho foi comparar a composição da fauna parasitaria de Hypostomus spp. coletados no Rio Batalha no estado de São Paulo e no Rio Ivaí no estado do Paraná. Indivíduos de Hypostomus hermanni e Hypostomus regani foram coletados em dois trechos do Rio Batalha e no Rio Ivaí. Após a coleta, os peixes foram necropsiados para obtenção dos parasitas, coletados com auxílio de estereomicroscópio óptico e identificados. No total, 163 indivíduos hospedeiros foram coletados e 21 espécies de parasitas foram registradas, principalmente ectoparasitas da classe Monogenea. Os Hypostomus spp. coletados no Rio Batalha apresentaram maior riqueza, sendo H. hermanni com 11 espécies e H. regani com 12 espécies. A maior prevalência registrada nessa localidade foi de Oligobdella sp. em H. hermanni (93,6%) e em H. regani (100%). Para o Rio Ivaí, os Hypostomus spp. apresentaram menor riqueza, sendo H. hermanni com 04 espécies e H. regani com 05 espécies. As maiores taxas de prevalência parasitária entre os hospedeiros para essa localidade foram de Austrodiplostomum compactum em H. hermanni (76%) e Procamallanus annipetterae em H. regani (90,9%). A análise PERMIDISP não foi significativa (p?= 0,63), indicando que não houve efeito de dispersão. A composição de espécies de parasitas foi significativamente diferente (PERMANOVA: F= 63,486, p?= 0,001). A PERMANOVA pareada mostrou diferentes composições de espécies de parasitas entre os hospedeiros das diferentes localidades.
