Leporinus é o gênero com maior riqueza de espécies em Anostomidae. A falta de conhecimento taxonômico de algumas espécies de Leporinus, juntamente com o caráter não monofilético do grupo, tem dificultado o entendimento de sua diversidade e evolução. Leporinus trimaculatus é uma espécie pouco conhecida, possivelmente endêmica do rio Aripuãna, na Amazônia, Brasileira, com relações filogenéticas desconhecidas. No entanto, faltam informações para definir a distribuição geográfica da espécie, bem como investigar sua posição filogenética. Neste sentido, o objetivo deste estudo é realizar a redescrição de Leporinus trimaculatus, investigando sua distribuição geográfica e posição filogenética. Para isso novos exemplares foram coletados no rio Aripuãna, acima e abaixo das cachoeiras de Andorinhas e Dardanelos. Os exemplares foram fotografados em vida, e tiveram tecidos removidos e fixados em álcool absoluto. Dados morfométricos e merísticos foram tomados dos exemplares coletados e esqueletos foram preparados para investigação osteológica. A posição filogenética da espécie foi investigada através de marcadores moleculares (COI, Cytb, Rag 1 e Rag2). Os resultados confirmam o endemismo de Leporinus trimaculatus para a porção alta do rio Aripuãna. Além disso, novos dados sobre o colorido em vida, caracteres morfológicos e merísticos, foram apresentados. A espécie é confirmada como pertencente ao clado que inclui Leporinus friderici. Nossos dados fornecem subsídios para a conservação de importantes áreas amazônicas, como a do alto Aripuanã.