Os rios enfrentam uma sérias ameaças, como mudanças climáticas, introdução de espécies invasoras poluição, desmatamento, represamentos, urbanização e assoreamento, que afetam negativamente a comunidade de peixes, especialmente na Bacia do Rio Sorocaba, onde a urbanização e uso incorreto da água comprometem a diversidade e a qualidade ambiental, resultando em mudanças na ictiofauna ao longo dos anos. O estudo foi realizado na Bacia do Rio Sorocaba, com área de drenagem de 11.829 km², investigando e comparando a ictiofauna nos períodos de 1995-1996 e 2020-2021. As coletas foram feitas utilizando redes de espera, arrasto, peneiras e puças. Para a comparação da comunidade de peixes foi utilizada a abundância e riqueza em ambos os anos, a análise multivariada não-paramétrica de variância (PERMANOVA), utilizando a dissimilaridade de Bray-Curtis, para uma representação visual foi utilizada o método de Escalonamento Multidimensional Não Métrico (NMDS) em duas dimensões. Ao todo foram capturados 1942 indivíduos pertencentes a 6 ordens, 17 famílias e 54 espécies. No primeiro período um total de 1270 indivíduos, 5 ordens, 16 famílias e 34 espécies foram inventariados, sendo 32 espécies nativas e duas espécies invasoras, sendo elas: Oreochromis niloticus e Cyprinus carpio, sem presença de espécies ameaçadas. No segundo período foram amostrados um total de 672 indivíduos, 5 ordens,15 famílias e 42 espécies, sendo 40 espécies nativas e duas espécies invasoras (Poecilia reticulata e Coptodon rendalli), sendo uma espécie ameaçada (Hyphessobrycon flammeus). Ocorreu a substituição da ordem Cypriniformes pela Cyprinodontiformes entre a primeira e segunda campanha e uma substituição nas espécies exóticas, Oreochromis niloticus e Cyprinus carpio pela Coptodon rendalli e Poecilia reticulata A análise de NMDS, com um valor de stress de 0,19, revelou diferenças significativas entre os períodos analisados, com um valor de p de 0,001.
